鏈下治理是指生態中的參與者在現實中進行協調商議如何對專案進行升級和更新。參與者需要進行多輪流程的討論協商，最終多數支持者的方案將被推廣和實施。整個過程與現實中的投票競選類似，其核心目的是為了使區塊鏈專案的生態發展的更好，利於大多數人的利益需求。鏈上治理則是指所有的治理程式都由區塊鏈網路來完成，任何透過的決議都將由程式碼來實現。鏈上治理的主要步驟如下：使用者可以制定提案並在全網公佈。然後，擁有治理權的參與者透過區塊鏈網路對提議進行投票。最後若票數足夠則提案透過，程式碼自動執行新方案。
從區塊鏈分類的角度來看，只有公鏈才會涉及到鏈上治理。由於公鏈採用的是開放式架構，因此所有使用者都可參與其中併成為其節點。一般來說，實施鏈上治理的公鏈專案都會將其生態內的通證作為使用者的投票權益，類似於公司內的股票，即股東的股份越大則對公司治理擁有更多話語權。聯盟鏈與私有鏈則是由固定幾個參與者形成的一個相對封閉的生態體系，因此內部治理許可權以及生態規則都較為穩定，治理權利以及利益分成將在幾個合作聯盟之間進行分配，因此無需透過鏈上治理來完成。另一方面，在聯盟鏈中一般不設有通證激勵，聯盟鏈的目的也並非由利潤驅動，因此聯盟鏈的執行模式較為固定不存在利益相關問題，不需要頻繁地進行治理。
與鏈下治理的方式相比，鏈上治理的模式對於普通使用者而言更為公平，參與者人數較多。然而透過鏈上進行治理的機制仍處於起步階段，發展至今擁有諸多缺陷。首先，鏈上治理時涉及的智慧合約存在安全隱患。若智慧合約未經過多重安全審計，將面臨駭客攻擊造成使用者的鏈上資產受損。第二，若是一通證一票的方案進行治理投票會造成生態內大戶壟斷治理權的問題，普通使用者的參與度下降。第三，個別公鏈設有質押投票的模式將會出現賄賂、中心化等問題。第四，公鏈的效能將影響鏈上投票的進度問題，若一些緊急修改提案未能及時被區塊鏈網路確認將會直接對生態造成較大損害。總體來看，鏈上治理仍未有一個較為完善和成熟的機制，但基於區塊鏈的鏈上治理已是一種完全顛覆傳統意義的治理模式。
目前來看哪種治理方案更有效各個社羣都未有良好的共識，對於普通使用者而言治理權雖然看似無關但卻決定了整個生態的發展，有效的治理方案對於行業的進步起到至關作用。鏈上與鏈下治理在某種意義上可以共存，透過多樣化的治理方式將整個專案生態的核心主導權交還給社羣使用者，讓他們自發形成維護生態良好發展的方向。隨著區塊鏈行業的發展以及規模化，未來的治理模式將會更加公平和有效。
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